Zelená biotechnológia zvyčajne zahŕňa genetickú technológiu a často sa nazýva aj „zelená genetická technológia“. Zahŕňa najmä genetickú modifikáciu pestovaných plodín. Medzi filozofické/etické otázky diskutované pod touto značkou patrí riziko kríženia medzi geneticky modifikovanými typmi rastlín a divokými typmi; používanie geneticky modifikovaných plodín pri výrobe potravín, či už priamo alebo nepriamo ako potraviny pre zvieratá určené na ľudskú spotrebu